Fator de transcrição em dedo de zinco que contém cinco DEDOS DE ZINCO CYS2-HIS2 e se liga à sequência consenso GLI 5'-GGGTGGTC-3'. A proteína inteira atua como um ativador transcricional, enquanto o terminal carboxila truncado atua como um repressor transcricional na via de sinalização de Shh. Um equilíbrio entre estas duas formas é crítico para o desenvolvimento dos membros e de dedos. O GLI3 também desempenha papel crítico na diferenciação e proliferação de CONDRÓCITOS.